GeneMarker
* 快速检测到在汇海子区域内的甲基化位点
* 准确发现甲基化位置。
* 提供内容丰富和形式多样的报表。
10.定量分析 (Quantitative Analysis)
定量分析工具能够快速的为研究人员找到复杂峰形曲线的峰下区域部分。GeneMarker提供以下两种区域计算法则供研究人员选择:
* 窗帘法: 允许用户自定义峰形曲线的起始点和结束点来实现峰下区域的计算
* 反卷积法: 通过比对所选样本的出峰区域和其他样本在相同位置的出峰信息实现峰下区域的计算
定量分析工具同时可以提供含有峰的强度,面积等丰富信息的数据报表方便相关领域分析人员的使用。
11.Arms/Comparative应用
Arms/Comparative 分析允许在一个工程中比较一组或多组独立给出的样本文件。该应用主要包括以下两类功能:
* 电泳峰图比较
* 等位基因报告(患者报告模式)
例如:如果我们使用一个多倍仪(Multiplex)对一条色带上的野生型等位基因(allele)进行测序,使用另外一个多倍仪对另外一个色带的多重变异等位基因 (例如已经发现的细胞纤维症中的GeneProbe®EU-2等位基因)进行测序,ARMS//Comparative应用分析程序能够为这两个独立生成的文件提供准确的,简要的比对结果。
12.亲缘关系分析 (Relationship Analysis)
亲缘关系分析工具依据孟德尔遗传定律,主要应用于以下两类领域
* 测试已知的基因型在一个家族中的遗传学关系
* 辅助分析遗传过程中可能产生的畸变
因为所选取的用于法医基因分型的核心基因座满足孟德尔遗传中的隔离与独立特征,所以该亲缘关系分析工具可以为相关领域的研究人员提供快速,准确的结果。
13.Codis文件导出
“Export Codis”工具是专门为是为需要创建报表并且上传到 DNA联合索引系统(CODIS)的法医学实验室所定制开发的。
“Export Codis”工具的主要功能如下:
* 允许用户添加一个或多个独立的样本到导出样本集
* 支持CMF3.2, CMF3.0和CMF1.0三种数据格式文件的生成。
14.族谱分析 (Pedigree Analysis)
族谱分析工具用于帮助研究人员鉴定在遗传过程中可能产生的遗传类型与畸变。
GeneMarker将所有在族谱分析图中出现的样本与其相应的峰图直接相连,对在个体样本中出现的不合理或不正常的等位基因标记成红色以示强调,从而使整个分析过程变得便捷和高效
15.三体细胞分析(Trisomy Analysis)
三体细胞分析工具可以根据STR基因座信息,以及峰图强度的比对结果准确探测出相关的三染色体片段。
GeneMarker三体细胞分析应用提供以下两种方法来鉴别强度比为2:1(或1:2)的三体细胞片段:
* 斜率修正法:根据峰的强度比值进行一次曲线的拟合。
* 三体细胞记分法:以样本标准差为基础,综合考虑杂合子和三染色体细胞的比值情况。
GeneMarker 技术指标:
1.支持试剂盒:
支持主流试剂盒与特殊试剂,如:
AB:SnaPshot、Identifiler、Minifiler、Sinofiler、Yfiler
ProMega:PowerPlex 16、PowerPlex 16HS
基点认知:Goldeneye 20A
中德美联:AGCU
公安部二所:DNATyper 15等
2.分析速度 处理1000个样本只需276秒
3.结果数据输出:
支持多种结果数据输出格式,并可根据用户需求自定义输出格式,如:
Codis(CMF3.2, CMF3.0,CMF1.0)、XML、TXT 、SCF Files,SG1 Files、等
4.操作系统:
支持 Windows XP、Windows Vista、Windows 7等目前主流操作系统。
技术服务:
本公司依托强大的系统与应用产品研发团队,建立了完善的产品售后技术支持服务体系,保证售后服务的及时响应、快速解决,为已经购买了本软件产品的最终用户提供如下的产品售后服务:
* 免费一年的软件更新服务及技术支持
* 提供培训课程、操作说明与使用手册
* 提供技术支持热线、在线技术服务
* 大专院校从事教育服务领域的机构及承担国家重大课题研究机构用户享受购买优惠,并可提供数据分析服务于软件功能定制服务
GeneMarker 成功案例:
部门 单位 地区
研究机构
沈阳基因组研究所 中国中科院 中国
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