GeneMarker

GeneMarker 概述: 

GeneMarker是国际生物信息学相关研究分析领域应用十分广泛的 DNA片断分析软件，旨在为领域科研人员、司法刑侦人员提供一个精确、快速、友好、自动化的数据分析平台。

GeneMarker是DNA片段数据分析领域的一个整体解决方案，集成了STR分析，遗传家系处理、峰图定量分析等十几个功能强大的分析应用模块，从而使操作人员摆脱了繁琐、费时的中间步骤，直接对实验结果进行更深入的分析。

GeneMarker还是一个开放的分析平台。作为一个独立于硬件厂商的软件产品，它不但可以支持多家厂商的数据格式，而且还不断增加对世界上各种最新DNA片断分析方法的支持，为您的研究工作提供更大的自由和持久不断的动力。

 
用GeneM arker 检测杂合缺失
用GeneM arker 研究三倍体症
用GeneM arker 分析研究AFLP
用GeneM arker 微卫星不稳定性

用GeneM arker 进行微卫星与家系分析

GeneMarker 主要应用:
 

GeneMarker能够处理ABI、Amersham、Beckman、SpectruMedix等公司的毛细管电泳仪输出的DNA片断峰图数据。它的应用领域有:

* 动、植物DNA短串连重复序列STR 数据分析

* 遗传学及古生物学相关研究

* 遗传家系绘图与孟德尔检验（支持Linkage、GeneHunter）

* 肿瘤学领域染色体杂合性缺失（LOH）分析，分析肿瘤患者染色体异常

* 法医和亲缘鉴定研究，支持混合样本分析

* DNA扩增片断长度多态性AFLP数据分析

* 对多重连接探针扩增所得到的数据的分析

* 高通量SNP分型及其聚类分析

* 用于高通量染色体和DNA异常诊断的MLPA®数据分析

* 微卫星不稳定性（MSI）数据分析

* DNA定量比对分析

 
GeneMarker 主要特点:
 

一、计算分析精确

采用专业优化的信号处理算法，帮助排除检测系统带来的噪音和干扰，使实验结果的真实原貌得到更准确的还原。如基线校正（Baseline Subtraction），相关性消除（Pull-up Removal），饱和信号修补（Saturation Repair）等。采用多种统计方法辅助分析，如Stutter Recognition、False Plus-A Correction等，自动鉴别信号，以得到最合理精确的分型结果。

二、快速分析数据及生成报告

快速准确计算出等位基因（Allele）的位置，获得等位基因的Repeat Number。优化的算法保证了数据处理运算的快捷，在我们的测试中，处理1000个样本只需276秒。良好的设计保障了软件的稳定运行，即使发生了意外，内置的异常处理模块也能防止程序的崩溃，使用户能及时保存数据。

三、友好的人机交互界面

友好的人机交互界面设计，支持多家厂商的数据格式。界面简单、友好，十分容易掌握，还提供向导界面，引导用户轻松完成数据处理和报告输出。支持自定义内标，支持自定义panel。自动判断每个DNA片段的内标种类。丰富的报告打印类型, 输出Allele报告；输出CODIS报告。

四、多个特殊定制功能

集成多个功能强大的工具和应用，如MLPA分析多重连接探针扩增数据分析、定量分析功能、单倍体（Haplotype）分析功能、MS-MLPA®甲基特异性分析、家族图谱关联的微卫星分析等多达15种定制服务功能，并已得到全球2000多家实验室和研究机构良好的使用。

 
GeneMarker 功能介绍:
 

GeneMarker是一款功能强大的基因分析工具，包含批量处理数据、生成质量报告、显示电泳胶图、基因分型分析等基础功能，如下图所示：

GeneMarker在运行中可以自动修正在基因型分析过程中出现的常见问题：比如饱和区出现的峰，噪声数据，试剂污染和仪器带来的误差以及stutter峰。GeneMarker提供自动运行向导可以使分析过程快速，便捷和准确。

个体样本中出现的不合理或不正常的等位基因会被标记成红色以示强调。

分析图与每个基因座的等位基因直接的链接，可以使整个分析过程便捷、高效。

 
GeneMarker的主要功能如下：
 

1.微卫星不稳定性分析（MSI Analysis）

微卫星不稳定性分析工具主要用于肿瘤样本的分析，它通过基于峰与峰之间对比的方式，将峰图的差异以直方图的形式直观的显示出来。

微卫星不稳定性分析应用程序为相关分析人员提供以下便捷：

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